CADtools8J: Illustratorの定規で任意に設定した原点とCADトラッカーの原点が一致しないのですが。

Illustrator CS5は、定規の仕様が変更されており、「ウィンドウ定規」を使用することで問題が解消します。「ウィンドウ定規」を使用するには、「表示」メニュー/「定規」から「ウィンドウ定規に変更」を選択してください。